宝塔第二层的铁塔
猜想宝塔
供奉的是释迦牟尼舍利
“五重宝塔是一件少见的、珍贵的、体现较高工艺水平的重要文物，抢救回来乃国之幸事!”在对它研究后，著名考古学家宿白先生表示。虽然五重舍利塔流失民间的过程现在无从考证，但它的回归有着深刻的意义。
疑问一 宝塔属什么年代？
考古专家们一致认为宝塔属唐末五代到宋（西夏、辽）时期。国家博物馆文物科技保护中心对五重舍利塔局部鉴定报告，认定舍利塔与唐代同代器物成分相近。
上世纪80年代主持法门寺地宫及释迦牟尼舍利发掘的考古专家韩伟指出，建国以来，隋唐时代的舍利容器有多次发现，却没发现过宝塔形式的舍利容器。塔式舍利容器上限不会超过五代时期，可能是宋代创造的一种瘗埋舍利的新形式。五重的舍利塔容器，是迄今考古的唯一发现。
宝塔第四层的银塔
疑问二宝塔主人是谁？
韩伟指出，舍利塔的套装层数达五重之多，与法门寺地宫出土的安放舍利容器的重数相同，依此而论，五重塔的舍利主人应该是佛教史上享有至高地位的人。金银塔上有释迦牟尼及佛涅槃多幅造像，这就证实了舍利主人的高贵。石塔顶部有五尊佛像，下面又刻有五幅宝轮，这“五佛顶尊”标志着佛的最高智慧，证明金塔内供奉着释迦牟尼舍利。
研究印度佛教的中国社科院亚太所教授黄心川认为，从涅槃像来分析，宝塔供奉的是释迦牟尼舍利，而且塔的建造等级为皇家级别。
疑问三 宝塔曾安放在哪？
因为在舍利塔修复期间，从里面清理出来的都是黄土，所以专家们断定塔的安放地点在北方，而如果是南方，里面应该是红土。这一推断得到了证实，王崇仁在购回宝塔时，卖主也透露塔是来自北方。
原国家文物鉴定委员会委员、中央美术学院教授金维诺指出，可以想象塔的基座比较大，难以搬动。因此，找到与舍利塔配套的东西，或许可以找到其他相关遗迹。考古专家宿白则表示，该舍利塔类型罕见，可能不是黄河流域中原地区的。由于没有对照和相应的考古佐证，很难判断原属哪个地区。
宝塔第五层的金塔
问题四 宝塔回归的意义？
专家们表示，衰败时文物流失，兴盛时文物回流，舍利五重宝塔的回归，显示了文化传统的自觉，对研究佛教史、舍利瘗（Yì，掩埋的意思）埋供养制度等，具有深刻的意义。
韩伟表示，唐代佛经中有关于“天网”（因陀罗网）的文字记述，但是在考古发掘中没有实物出现。五重塔的银塔与金塔整体，包裹着银丝串缀珍珠的天网，这是佛教考古史上填补空白的重大发现。
