796,095平方公里（不包括巴控克什米尔）。
巴基斯坦位于南亚次大陆的西北部。地处北纬23度30分至36度45分，东经61度至75度31分之间，南北长1600多公里。巴南濒阿拉伯海，海岸线长840公里，北枕喀喇昆仑山和喜马拉雅山。同巴毗连的国家有印度、中国、阿富汗和伊朗。
行政区划：旁遮普省（205,334平方公里），信德省（140,914平方公里），西北边省（74,521平方公里），俾路支省（347,190平方公里），以及联邦首都地区伊斯兰堡（906平方公里）和联邦管辖部落地区（27,220平方公里）。巴实际控制的克什米尔的一部分，划分为联邦管辖的北部地区（72,496平方公里）和查谟和克什米尔（13,279平方公里）。该二个地区的人民持巴基斯坦护照，享有对该地政府的选举权，不享有对中央政府的选举权。
山脉：被誉为“世界屋脊”的喀喇昆仑山脉与喜马拉雅山脉部分在巴和巴控克什米尔境内。位于中巴边界的乔戈里峰（巴称Ｋ－２峰），海拔8611米，是喀喇昆仑山最高峰，也是世界第二高峰。兴都库什山脉自东向西横跨巴西北部，最高峰为米尔峰，海拔7736米。苏莱曼山脉自北而南，北部与兴都库什山脉相连。其北段形成巴与阿富汗的边界，著名的开伯尔山口位于该段的峡谷中，成为巴阿间的交通要冲。苏莱曼山脉东部连结盐山山脉。此外，巴中南部有基尔山脉和帕布山脉。基尔山自北而南，将俾路支高原和印度河平原分开。巴中部有托巴？卡卡山脉和申拉胡伊山脉。西雅罕山脉和马克兰山脉中段位于巴西南部。
河流：巴河流大都自东北流向西南。最长的印度河几乎穿贯全巴，其源头在中国西藏，经过克什米尔，进入印度河平原后汇入阿拉伯海。印度河平原南北长1,280公里，东西宽320至560公里，是巴最富庶的农业区，上游主要是旁遮普省，下游是信德省。这里有世界上最大的灌溉网之一，大小水渠的总长度达6.4万公里。由于印度河流速缓慢，携带淤泥几乎全沉淀于河床，久而久之使河床高于平原。因此，在河两岸筑起河堤以免土地受淹。然而，每当夏季北部高山上积雪融化时，印度河水猛涨，若再遇上南部的季风大雨，则经常泛滥成灾。其他河流还有：杰卢姆河、奇纳布河、拉维河和萨特勒季河。它们都是印度河的支流，同印度河一起称作五河(PENJ-AB)。此外，喀布尔河则自西向东流入印度河。
